Después llegó la guerra.
A comienzos de 1940 se presentó como último juguete Schuco el Wendeboot, un juguete que no estaba destinado al agua, sino únicamente a funcionar sobre una mesa.
En apenas cinco años —de 1935 a 1939— Schuco había transformado y revolucionado prácticamente todo el mercado del juguete. Competidores alemanes y extranjeros intentaron copiar, imitar y comercializar con la misma identificación productos que habían tenido un gran éxito.
Como contrapartida a su éxito mundial, durante la Segunda Guerra Mundial Schuco tuvo que trabajar para fabricar espoletas para proyectiles, con el fin de cumplir las difíciles exigencias de Suiza, España y Suecia. Naturalmente, durante estos años el número de empleados fluctuó considerablemente.
En 1936, el señor Müller podía llegar a contar con alrededor de 1000 empleados.
En 1939, el socio judío Adolf Kahn tuvo que abandonar la empresa. Aunque quiso retirar sus participaciones mediante pagos de exportación y transferirlas a Nueva York, Heinrich Müller logró que la empresa continuara funcionando correctamente.
A pesar de ello, Schuco tuvo que producir durante la guerra para la industria armamentística. Después de la guerra, la empresa quedó sometida a la administración militar.
Inmediatamente después del fin de la guerra se permitió continuar trabajando, inicialmente fabricando cajas de hojalata y timbres de puerta, que se necesitaban con urgencia en los primeros tiempos de la posguerra.
Hasta 1949, tras la reforma monetaria, los juguetes Schuco no pudieron volver al mercado alemán.
Los modelos Akustico, Examico y Kommando-Auto volvieron a aparecer, pero no eran novedades.
En 1950 surgieron dos productos de auténtica novedad: el Schuco-Curvo Fox 1011 y el Ingenico.